Яковлев Алексей Юрьевич в 1994 году окончил кораблестроительный факультет Санкт Петербургского государственного морского технического университета (СПбГМТУ) по специальности прикладная математика.

После окончания СПбГМТУ долгое время работал во ФГУП «Крыловский государственный научный центр» - последовательно пройдя должности инженера, научного и старшего научного сотрудника, начальника сектора, заместителя начальника отделения – начальника отдела управления проектами. С 2004 года Яковлев А.Ю. работает в СПбГМТУ на кафедре Гидроаэромеханики и морской акустики – в должностях доцента и профессора (в качестве внешнего совместителя), а с 2018 г. – заведующего данной кафедрой.

В 1999 г. Яковлев А.Ю. защитил кандидатскую, а в 2007 году - докторскую диссертацию на тему «Создание системы расчетных методов для проектирования новых типов движительных комплексов современных судов». В 2005 г. ему присвоено ученое звание доцента.

В 2015 году Яковлев А.Ю. прошел повышение квалификации в Санкт- Петербургском международном институте менеджмента и получил сертификат Project Manager.

Яковлев А.Ю. является членом экспертного совета ВАК по проблемам флота и кораблестроению и членом двух диссертационных советов. В 2014 – 2019 годах состоял членом Пропульсивного комитета Международной конференции опытовых бассейнов (ITTC) в качестве представителя от России и Северной Европы.